空軍基於貫徹精兵政策目標及新一代兵力成軍所需，依國防部87年3月13日(87)澳奉字第0429號令，將前空軍東部指揮部指揮部裁撤，於民國87年7月1日成立「空軍教育訓練暨準則發展司令部」(Air Education Training&Doctrine Doctrine Development Command)，直隸空軍總司令部，下轄空軍第七三七戰術戰鬥機聯隊、空軍航空技術學院、空軍基地訓練指揮部、空軍測評戰研中心。
因應國軍「精準案」組織調整，依國防部95年2月22日略畫字第0950000245號令核定，本部銜稱修編為「空軍教育訓練暨準則發展指揮部」，95年3月1日生效，隸屬於國防部空軍司令部，下轄空軍航空技術學院、空軍基地訓練指揮部、空軍測評戰研中心、空軍戰術訓練中心。
100年7月1日，憲兵第三五七營裁編為憲兵十一中隊，移編本部以統一國軍指揮體系及健全部隊實務工作推展；102年7月1日，空軍戰術訓練中心與空軍測評戰研中心併編；103年11月1日，國軍防空砲兵訓練中心改隸本部部外一級單位，並更銜為國軍防空砲兵部隊訓練中心；106年1月1日，空軍測評戰研中心裁撤。值此，本部下轄空軍航空技術學院、空軍基地訓練指揮部、國軍防空砲兵部隊訓練中心、憲兵第十一中隊，並赓續督導學校教育、精進部隊訓練、專精戰訓測考、基地組合訓練、落實準則發展等五大功能，強化本軍教育體制，整合訓練權責單位，建立準則發展專責機構，使戰術戰法研發、人員訓練、戰力整備與測考等脈絡一貫，達成建軍備戰需求。
本部平時負責執行準則發展、學校教育部隊訓練與戰訓測考，戰時依令於預備空軍作戰中心(JAOC)/空管制中心(ACC)接替作戰地區之空中作戰指揮與管制，並負責規劃支援西部決戰兵力分散部署時進駐佳山、石子山之作業與防護。