空軍防空暨飛彈指揮部
本部前身為「空軍防空砲兵指揮部」及「空軍防空飛彈指揮部」。在先總統蔣公「無空防及無國防」昭示下，防空高射砲兵部隊於民國22年在大陸杭州梅東高橋籌設高射砲班，民國38年成立「空軍高射砲兵司令部」，駐地臺北縣三重埔，飛彈部隊民國48年奉令編成「陸軍飛彈第一營」，駐地臺北淡水，防砲部隊於民國51年改銜為「空軍防空砲兵司令部」，駐地臺北南機場，民國61年從臺北南機場遷駐至桃園縣八德鄉更寮腳忠勇營區。
飛彈部隊於民國65年，依「南寧案」規劃，在中、南部及澎湖地區成立鷹式飛彈第664營，駐防於小港大坪頂，飛彈部隊於民國78年編成天弓實驗隊，民國80年天弓實驗隊圓滿完成任務，於同年5月力士第1連換裝中科院自行研發之天弓飛彈系統，改編天弓第1連。防砲部隊於民國80年併編空軍警衛指揮部，成立「空軍防空警衛司令部」，負責指導防空作戰與地面警衛作戰任務，既察長空於纖毫，復戍平野之縱橫，戒備尤甚。
民國95年執行和平專案演習，本屬警衛部隊移編憲兵司令部，飛彈指揮部所屬防空飛彈部隊移編本部，更名為「空軍防空砲兵司令部」，3月1日奉令改銜為「空軍防空砲兵指揮部」。
民國101年執行「泰安專案」，中、長程防空飛彈部隊移編國防部參謀本部飛彈指揮部。
民國106年執行「飛展專案」，將「空軍防空飛彈指揮部」移編本部並改銜為「空軍防空暨飛彈指揮部」。
民國111年，依國防部政策指導執行「長鬆專案」，遷駐至高雄旗山，本部隸屬國防部空軍司令部，負責策劃與督導空軍防空飛彈砲兵部隊之兵力整建、部署、派遣、戰力整備、陣地配置、任務訓練等，以遂行防空作戰任務。